هنگامی که خدمه سفینه فضایی به خانه باز می گردند شاهد انفجاری عظیم می شوند که همه چیز را در هم می ریزد . کاپیتان کرک مامور می شود که عامل این خرابی را که گویا یکی از خودی ها است ، پیدا کند و در حین اینکار درگیر ماجراهایی می شود و ...

 اکنون کاپیتان جیمز تی کرک به همراه افرادش از طرف پایگاه ارهارت برای بررسی چندین موضوع سفر خود را آغاز میکنند ولی پس از رخ دادن اتفاقاتی در یک سیاره ناشناخته و عجیب فرود می آیند. آنها متوجه می شوند که با یک بیگانه به نام کرال مواجه هستند که باید یا او را از میان بردارند یا اینکه با او متحد شوند…

بعد از اینکه سفینه اینترپرایز به طرف سیاره رومولوس منحرف می شود، فدراسیون متوجه می شود که رومولان ها قصد حمله به زمین را دارند...

«فرمانده کرک» به کمک خدمه سفینه اینترپرایز باید جلوی یک کینه جوی بنام «خان نونین سینگ» که قصد استفاده از ماشین جنسیس را دارد، را بگیرد...

«فرمانده پیکارد» و خدمه اش، بروگ ها را در سفر زمانی به گذشته تعقیب می کنند، تا مانع از بر هم زدن اولین تماس زمینی ها با موجودات بیگانه فضایی در تاریخ شوند...

«فرمانده کرک» و خدمه اش برای نجات زمین از حمله بیگانگان، در زمان سفر کرده و به قرن بیستم می روند تا تنها موجوداتی که می توانند زمین را نجات دهند اما اکنون منقرض شده اند (گونه ای از وال ها) را با خود به زمان حال بیاورند...

کاپیتان پیکارد و کاپیتان کرک قصد متوقف کردن مرد دیوانه ای را دارند که میخواهد کشتاری وسیع به راه بیندازد...

جورج گریگ که فرمانده یک سفینه فضایی است به دست نیرو که از سیاره ای دیگر آمده نابود می شود همانروز از وی بچه ای به دنیا می آید که نامش را جیمز می گذارند جیمز وقتی بزرگ می شود به خدمت سفینه فضایی در می آید تا جای پدر را بگیرد از آن طرف نیرو با ماده ای که اختراع کرده سیاره ای را نابود می کند و اکنون قصد دارد با همان ماده به جنگ زمین بیاید اما سفینه اینتر پرایز که جیمز نیز در آن است قصد دارد جلوی این کار را بگیرد...

توطئه ي فدراسيون و متحد خود سرش سياره ي «سونا» براي تغيير مکان يک جامعه ي کوچک و بي آزار کشف مي شود. فرمانده سفينه ي «انترپرايز»، «پيکارد» (استوارت)، و مشاوران نظامي اش نيز وارد عمل مي شوند و مي کوشند تا اين توطئه را نقش بر آب کنند...

تاريخ ستاره اي 92106. پس از سال ها جنگ سرد، «صدراعظم گورکن» (وارنر) به «فدراسيون» پيشنهاد صلح مي دهد. اما او به قتل مي رسد و «فرمانده کرک» (شاتنر) و «مکوي» (کلي) به خاطر اين جنايت محاکمه و محکوم مي شوند. حالا «آقاي اسپاک» (نيموي) فرماندهي اينترپرايز را به عهده مي گيرد و به دنبال مدارکي مي گردد تا دست قاتلان واقعي را رو کند.

«فرمانده کرک» و خدمه اش با بخطر انداختن جان شان، سفینه اینترپرایز را دزدیده و با آن به سیاره جنسیس باز می گردند تا بدن «اسپوک» را بدست آورند...

قرن بيست و سوم.خبرهاي رسيده از مقر فرماندهي استارفليت در سن فرانسيسکو، حاکي از هجوم نيروهاي عظيم ابري شکلي به سوي زمين است. «فرمانده کرک» (شاتنر) فرماندهي سفينه ي قدیمي اينتر پرايز را براي مقابله با اين هجوم به عهده مي گيرد...