هنگامی که خدمه سفینه فضایی به خانه باز می گردند شاهد انفجاری عظیم می شوند که همه چیز را در هم می ریزد . کاپیتان کرک مامور می شود که عامل این خرابی را که گویا یکی از خودی ها است ، پیدا کند و در حین اینکار درگیر ماجراهایی می شود و ...

:داستان فیلم در سال ۲۲۳۳ اتفاق می افتد ، ولی به طرز خاصی یادآور فیلم های قدیمی هالیوودی در ژانر فضایی است.این بار دو پسر جوان مشتاق با نامهای جیمز و اسپاک با گروهی از اعضای سفینه فضایی برای نجات دنیا از شر نیروهای شیطانی فضایی اقدام به سفر به نقاط ناشناخته فضا می کنند و جیمز که در دوران بچگی پس از نجات از یک حادثه رانندگی با یکی از موجودات فضایی دیدار کرده است برای این سفر بسیار مشتاق است اما در این سفر با اتفاقات و زندگی های عجیبی روبرو می شود...

«فرمانده پیکارد» و خدمه اش، بروگ ها را در سفر زمانی به گذشته تعقیب می کنند، تا مانع از بر هم زدن اولین تماس زمینی ها با موجودات بیگانه فضایی در تاریخ شوند...

بعد از اینکه سفینه اینترپرایز به طرف سیاره رومولوس منحرف می شود، فدراسیون متوجه می شود که رومولان ها قصد حمله به زمین را دارند...

«فرمانده کرک» و خدمه اش برای نجات زمین از حمله بیگانگان، در زمان سفر کرده و به قرن بیستم می روند تا تنها موجوداتی که می توانند زمین را نجات دهند اما اکنون منقرض شده اند (گونه ای از وال ها) را با خود به زمان حال بیاورند...

«فرمانده کرک» به کمک خدمه سفینه اینترپرایز باید جلوی یک کینه جوی بنام «خان نونین سینگ» که قصد استفاده از ماشین جنسیس را دارد، را بگیرد...

توطئه ي فدراسيون و متحد خود سرش سياره ي «سونا» براي تغيير مکان يک جامعه ي کوچک و بي آزار کشف مي شود. فرمانده سفينه ي «انترپرايز»، «پيکارد» (استوارت)، و مشاوران نظامي اش نيز وارد عمل مي شوند و مي کوشند تا اين توطئه را نقش بر آب کنند...

«فرمانده کرک» و خدمه اش با بخطر انداختن جان شان، سفینه اینترپرایز را دزدیده و با آن به سیاره جنسیس باز می گردند تا بدن «اسپوک» را بدست آورند...

کاپیتان پیکارد و کاپیتان کرک قصد متوقف کردن مرد دیوانه ای را دارند که میخواهد کشتاری وسیع به راه بیندازد...

تاريخ ستاره اي 92106. پس از سال ها جنگ سرد، «صدراعظم گورکن» (وارنر) به «فدراسيون» پيشنهاد صلح مي دهد. اما او به قتل مي رسد و «فرمانده کرک» (شاتنر) و «مکوي» (کلي) به خاطر اين جنايت محاکمه و محکوم مي شوند. حالا «آقاي اسپاک» (نيموي) فرماندهي اينترپرايز را به عهده مي گيرد و به دنبال مدارکي مي گردد تا دست قاتلان واقعي را رو کند.

قرن بيست و سوم.خبرهاي رسيده از مقر فرماندهي استارفليت در سن فرانسيسکو، حاکي از هجوم نيروهاي عظيم ابري شکلي به سوي زمين است. «فرمانده کرک» (شاتنر) فرماندهي سفينه ي قدیمي اينتر پرايز را براي مقابله با اين هجوم به عهده مي گيرد...